MinION™ Mk1D 是新一代便携式纳米孔测序设备，采用 USB-C 接口设计，兼容现代笔记本电脑、台式机及 iPad Pro（需配合即将推出的专用配件）。

与前代产品 MinION Mk1B 相比，MinION Mk1D 在散热性能上进行了优化，显著提升了测序表现，从而支持在更广泛的环境条件下实现高精度实时测序。设备配备直观的状态指示 LED 灯，可实时显示运行状态。

MinION Mk1D 支持使用 MinION 测序芯片和 Flongle™ 测序芯片（后者需配套适配器），可执行DNA 和 RNA 测序。设备由 MinKNOW™ 软件控制，负责设备及测序芯片操作、数据采集与碱基识别等核心功能。

*电子设备的工作环境温度为+5℃至+40℃。

MinION Mk1D 技术规格

MinION Mk1D 的 IT 配置要求

安全性及合规性信息

请点击此处，查看有关MinION Mk1D的常见问题解答。

MinION Mk1D 包装内含：

• 1x MinION Mk1D
• 1x USB-C 对 USB-C 数据线 （0.5 米）
• 1x 配置测试芯片（CTC）
• 1x 快速入门指南
• 1x 安全性及合规性文档

上盖 - 上推并翻开上盖，将测序芯片插入设备。 设备使用过程中，应将上盖闭合。

金属固定夹 - 打开上盖时，金属固定夹会自动弹起，用于牢固固定测序芯片或配置测试芯片（CTC）。当取出芯片并完全闭合上盖后，固定夹将自动回缩至设备内部。

配置测试芯片 （CTC） - 一种非功能性测序芯片，用于硬件检测过程中，验证测序芯片、设备与计算机之间的通信是否正常。

USB-C 接口 - 用于将 MinION 连接至本地计算机，以实现设备供电与数据传输。

LED状态指示灯 - 当设备与运行 MinKNOW 的计算机建立连接后，状态指示灯用于指示设备当前的工作状态。

设备启动时，指示灯将依次亮起，显示启动进程。当所有指示灯呈白色（或插入测序芯片后呈蓝色）时，表示设备已就绪，可投入使用。

• 白色LED：未插入测序芯片
• 蓝色 LED：序芯片已插入，脚本执行成功
• 绿色滚动 LED：脚本运行中
• 红色闪烁 LED：脚本运行出错

注意： MinKNOW™ 自 24.06.16 版本起全面启用LED状态指示功能。早期版本中，指示灯始终为青色常亮状态。

请参阅 IT 要求文档 ，确保计算机配置满足 MinION Mk1D 的运行要求，否则可能影响测序性能。

Oxford Nanopore的所有测序仪均采用MinKNOW™ 作为核心测序软件。MinKNOW 软件负责执行多项关键任务，包括：数据采集、实时分析及反馈、碱基识别、数据流传输、仪器控制、以及为待测样本提供适配的测序脚本。

测序过程中，MinKNOW 通过检测 DNA 或 RNA 链通过纳米孔时产生的特征电流变化，将原始信号转换为序列片段，并进一步完成碱基识别，生成可供后续分析使用的结果。

有关在 Windows、macOS 或 Linux 系统上安装最新版 MinKNOW 软件的详细说明，请参阅 MinKNOW 实验指南 。

The hardware check generates a report in HTML format and contains the following information:

• Number of positions that passed/failed the hardware check on the device
• Date and time that the hardware check was completed
• Hardware check ID
• Device ID

Summary shows the overall result for each position following a hardware check.

Connection check detailed results contains information on whether the connection check passed or failed for the selected position with the option to hide passed positions.

Temperature check detailed results contains information on whether the temperature check passed or failed for the selected position with the option to hide passed positions. Note that the temperature check is not included in the hardware check for MinION Mk1D devices.

An example report is shown below:

在文库上样前，请务必对测序芯片的活性纳米孔数进行质检。

质检应在收到 MinION 测序芯片后的 12 周内，或收到 Flongle 测序芯片后的 4 周内完成。Oxford Nanopore Technologies会对活性孔数量少于以下标准的芯片进行替换*：

*（请注意：自收到之日起，测序芯片须始终按照 储存条件 妥善保存，并须在完成质检后的两天内提交检测结果。）

测序芯片下方将有进度栏显示检测进度。

测序概览（Sequencing Overview）页面将显示测序芯片的质量状态，分为以下三种类型：

1.黄色感叹号（Flongle 测序芯片）: 活性测序孔数量低于保证范围。 将芯片从测序设备中取出后重新插入，并运行测序芯片质检。如果测序芯片活性孔数仍然低于质保范围，请（通过Live Support）联系客户支持。

2.绿色对勾（MinION 测序芯片）： 活性测序孔数量在质保范围之上。

3.橙色问号（Flongle 测序芯片）: 测序芯片在本次MinKNOW使用期间还未经过质检。

请注意： 芯片质量指示框仅在当次MinKNOW使用期间可见。一旦本次使用结束，测序芯片的状态信息将被清除。

测序前，您需备好经过纯化的DNA或RNA样本并完成建库。有关样本制备的更多信息，请参阅纳米孔社区“Documentation”栏目的 Prepare 部分。

您可通过 此链接访问MinKNOW实验指南。

当有可用更新时，用户将在首次打开 MinKNOW 软件时，于 “测序设备设置”（Host Settings） 页面收到弹窗提示。您也可以直接访问纳米孔社区的软件下载页面，手动下载最新版软件。

对GPU:

sudo apt clean
sudo apt update 
sudo apt install ont-standalone-minknow-gpu-release

对CPU:

sudo apt clean
sudo apt update 
sudo apt install ont-standalone-minknow-release

MinKNOW 将被更新至最新版本。上述命令成功执行后，请使用以下命令关闭设备并重启：

sudo reboot

某些 MinKNOW 更新可能包含 MinION Mk1D 固件升级内容。若更新中包含固件，则 MinION Mk1D 在更新后首次连接至计算机时将自动启动固件升级。升级过程中，设备将在 MinKNOW 中处于不可选状态，界面将提示信息“固件正在更新”。同时，设备指示灯将显示更新进度。升级完成后，设备将自动重启，指示灯也将恢复为常规状态。

整个更新过程约持续 2.5 分钟。请勿在此期间断开设备与计算机的连接。

在早于 MinKNOW 24.11 的版本中，固件更新过程无界面提示或指示灯反馈。更新期间，设备可能在 MinKNOW 中暂不可见，或显示为“测序设备已断开”（device disconnected）。

如您在使用 MinION Mk1D 或 MinKNOW 软件期间遇到问题，通常需要提供日志文件，以协助客户支持团队进行故障排查与分析。 日志文件默认存储路径如下：

Windows: C:\Data\logs\

Mac: /var/log/MinKNOW/

Ubuntu: /var/log/minknow/

Dorado 碱基识别日志的默认保存路径：

Windows: C:\Data\dorado_logs\

Mac: /var/log/dorado/

Ubuntu: /var/log/dorado/

注意： 如已更改 MinKNOW 的默认输出路径，日志将保存在自定义目录下的 “logs”子文件夹中。