ワークフロー：エピジェネティクス
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PCRフリーのナノポアシークエンスにより ヒトゲノムのメチル化をコール
メチル化は遺伝子発現の調節に基礎的な役割を果たしており、メチル化パターンの異常には、がんや発達障害など 多くの疾患と強い関連があります。例えば、5-メチルシトシン（5mC）修飾ヌクレオチドは重要な転写抑制因子の 1つであり、ゲノムインプリンティングを媒介しています。
ナノポアシークエンスにPCR増幅は不要なため、追加のサンプルを調製することなく、通常のシークエンスを行い、 塩基配列を取得すると同時に塩基修飾もコールできます。また、ナノポアシークエンスではGCバイアスが生じない ため、一定のリードカバレッジを確保し、従来のシークエンス法やメチル化コール法ではアクセスできなかったゲノ ム領域に容易にアクセスできます。
Overview
Methylation plays a fundamental role in regulating gene expression; aberrant methylation patterns are strongly associated with numerous diseases, such as cancer and developmental disorders. With PCR-free nanopore sequencing of native DNA, methylation can be directly detected at single-nucleotide resolution. This end-to-end workflow provides a simple solution for genome-wide methylation calling from a human blood research sample.
In this workflow, you will:
- Find out how PCR-free nanopore sequencing enhances methylation detection
- Discover our best practice sequencing workflow in detail, starting from the recommended extraction method, through to primary analysis
- Learn about our recommended sequencing kit and devices