微生物は地球上に最も豊富かつ多様に存在する生命体で、数百万〜 数兆種が存在すると推定されています(図 1)1,2。あらゆる生態系に不可欠 な要素であり、健康、疾患や多くの産業工程にきわめて重要な役割を 果たしています。
微生物学の分野はシークエンス技術により多大な影響を受けてきました。従来は人工培地を 用いて個々の種や菌株を培養することにより微生物を研究していましたが、これまでに登録 された約 1,000 万種のうち、ラボで培養されているのはわずか 10,000 種(0.1%)前後です 2 。 最新のシークエンス技術の登場により、培養微生物だけでなく非培養微生物も対象にして ハイスループットなゲノム解析が可能になり、微生物を同定して特性を解析する能力が劇的に 向上しました。
Overview
Microorganisms are the most abundant and diverse forms of life, and genome sequences for approximately 490,000 microbial strains are now publicly available. However, due to the limitations of legacy short-read sequencing technologies, approximately 90% of bacterial genome assemblies are incomplete.
This white paper discusses the advantages of nanopore reads with unrestricted length, which can be generated in real time to overcome these challenges to deliver affordable, reference-quality genome assemblies from microbial isolates and metagenomic samples.
In this white paper, you will:
- Learn the importance of complete microbial sequencing and its recent developments
- Discover the limitations of legacy sequencing technologies
- Find out how nanopore sequencing overcomes these limitations
- Read real-world case studies of how researchers are utilising nanopore sequencing to deliver new insights