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使用 Qiagen Puregene 试剂盒从人全血中提取基因组 DNA


简介

本指南介绍了使用 Qiagen Puregene® Blood Kit(血液 DNA 提取试剂盒)从人血样本中提取基因组 DNA 的方法。

实验材料

  • 人全血:≥ 1 ml(使用 EDTA K2 真空采血管采集)

耗材

  • Puregene Blood Kit(血液 DNA 提取试剂盒,Qiagen, 158023)
  • 异丙醇,100%(Fisher, 10723124)
  • 新制备的 80% 乙醇(用无核酸酶水配制)
  • TE 缓冲液(10 mM Tris-HCl、1 mM EDTA、pH 8.0)(Fisher scientific,10224683)
  • 无核酸酶水(如 Thermo Scientific,AM9937)
  • 吸水材料(如吸水纸或纸巾)
  • Qubit™ dsDNA BR Assay(双链DNA宽范围检测)试剂盒(Invitrogen,Q32850)
  • Qubit™ 分析管(Invitrogen, Q32856)
  • 15 ml Falcon 离心管
  • 1.5 ml Eppendorf DNA LoBind 离心管

可选耗材:

  • 基因组 DNA 165 kb 分析试剂盒(Agilent,FP-1002-0275)

器材

  • 适用于 15 ml Falcon 管的离心机及转子
  • 设定为 37°C 和 50°C 的培养箱或水浴锅
  • 涡旋混匀仪
  • 迷你离心机
  • Qubit™ 荧光计(或用于质控检测的等效仪器)
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • 宽口移液枪头
  • P1000 移液枪和枪头
  • P200移液枪和枪头
  • P20 移液枪和枪头
  • P10 移液枪和枪头
  • P2 移液枪和枪头

可选仪器:

  • Agilent Femto Pulse 系统(或用于读长质控的等效仪器)

方法

基因组 DNA 提取

1.向 15 ml Falcon 管中加入 3 ml 红细胞裂解液(RBC Lysis Solution)。


2.充分混匀 EDTA K2 采血管中的血液,然后取 1 ml 血液样本加入含有红细胞裂解液的离心管中。


3.将离心管上下颠倒混匀 10 次。


4.室温(15–25°C)下孵育5分钟。孵育期间,至少将离心管颠倒混匀 1 次。


5.以 2000 x g 离心两分钟以沉淀白细胞。


6.小心弃去上清液,确保管内留有白细胞沉淀及约 200 μL 液体。

上清液可用移液枪吸除,或直接倾倒至吸水材料上。


7.轻弹离心管,并/或用宽口枪头轻轻吹打,将白细胞沉淀重悬于残留液体中。

细胞沉淀在重悬后应完全分散,以利于后续的细胞裂解步骤。


8.加入 3 ml 细胞裂解液(Cell Lysis Solution)。

使用宽口枪头轻柔吹打 10–15 次,直至样品完全均一、无结块。确保溶液混合均匀。


9.37℃ 下孵育 30 分钟。

孵育结束时,请确保溶液充分均一,且无结块残留。
必要时,可使用宽口移液枪头吹打混匀,或轻柔倒转各管以促进溶液混匀。


10.加入 15 μl RNase A 溶液,在 37°C 孵育 15 分钟。


11.将反应管转移至冰浴中,冷却 3 分钟,使样本迅速降温。


12.向样本中加入 1 ml 蛋白沉淀液(Protein Precipitation Solution)。将离心管涡旋振荡两次,每次 5 秒。


13.2000 × g 离心 5 分钟。

蛋白应形成紧实的红褐色沉淀。若蛋白沉淀不够紧实,可将离心管在冰上放置 5 分钟后重复离心。


14.在一支新的 15 ml Falcon 管中加入 3 ml 异丙醇。


15.将样品管中的上清液小心倒入装有异丙醇的 15 ml Falcon 管中。

倾倒过程中应确保蛋白沉淀保持完整,不被扰动。

或者,您也可使用移液枪转移上清液,操作过程中同样应确保蛋白沉淀保持完整,不被扰动。

注意: 如蛋白沉淀在任何步骤中被扰动,请重新以 2000 × g 离心 10 分钟。请确保仅转移澄清的上清液,防止蛋白污染最终洗脱液。


16.轻柔倒转离心管约 50 次混匀,直至 DNA 呈丝状或结块。


17.2000 × g 离心 3 分钟。

DNA 可能在管底形成小的白色沉淀。


18.小心弃去上清液,并将离心管倒置在干净的吸水纸上以沥干残液。确保 DNA 沉淀未被扰动且留在管内。

上清液可用移液枪吸除,或直接倾倒至吸水材料上。操作时需小心,DNA 沉淀可能较为松散,容易脱落。


19.准备 300μl 新制备的 80% 乙醇(用无核酸酶水配制),置于冰上。


20.向样品中加入 300 μl 预冷、新鲜配制的 80% 乙醇,轻轻倒转数次以清洗 DNA 沉淀。


21.将 DNA 沉淀及全部 300 μl 乙醇转移至一支新的 1.5 ml Eppendorf 离心管中。


22.2,000 × g 离心 1 分钟。


23.小心弃去上清液,并将离心管倒置在干净的吸水纸上以沥干残液。确保 DNA 沉淀未被扰动且留在管内。

上清液可用移液枪吸除,或直接倾倒至吸水材料上。操作时需小心,DNA 沉淀可能较为松散,容易脱落。


24.打开管盖,将 DNA 沉淀在空气中干燥 1 分钟。

请避免过度干燥,DNA 沉淀不应干燥至开裂。


25.向 DNA 沉淀中加入 100 μl TE 缓冲液(10 mM Tris-HCl、1 mM EDTA、pH 8.0)。轻弹离心管以重悬沉淀。


26.在 50°C 下孵育 2 小时,期间使用宽口枪头不时混匀全部体积(100 μl)。

DNA 沉淀可能需要一定时间才能完全溶解;定量前请确保溶液已充分混匀。

可选:孵育步骤亦可在室温下过夜完成。

DNA 定量

  • 使用 Qubit dsDNA BR Assay(双链 DNA 宽范围检测)试剂盒对样品进行三次定量。在继续后续步骤前,请确认三次测量结果一致。

核酸提取后,通常可获得 10–30 μg 的 gDNA。
Qubit 测得浓度的预期范围为 100–300 ng/μl。


  • 如果 Qubit 测量结果存在较大差异,可能是由于 DNA 未充分重悬混匀所致。

此时建议延长孵育时间,以促进 DNA 完全溶解。

注意: 将样品置于恒温混匀仪内,在 50°C 条件下以 300 RPM 轻柔振荡孵育,可促进洗脱,或使用翻转式混匀仪。


  • 您可使用 Femto-Pulse(Agilent)评估所提取 gDNA 的长度和质量。

下图为使用 Puregene Blood Kit(血液 DNA 提取试剂盒)从人血样本中提取的 gDNA 片段长度分布示例:

gDNA extract frag analyser human blood variant e2e

变更记录

日期 版本 更新内容
2026 年 11 月 11 日 v1 初版
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Last updated: 11/11/2026

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