PromethION 2 Solo - 设备及 IT 配置规格
Requirements
PromethION 2 Solo - 设备及 IT 配置规格
FOR RESEARCH USE ONLY
Contents
设备型号
设备与 IT 配置规格
常见问题
附录 A：运输和物流
附件B：兼容性
变更日志
设备型号
PromethION 2 Solo（PRO-SEQ002）
设备与 IT 配置规格
概览
The PromethION™ 2 (P2) Solo 是 PromethION 系列中最小巧易用的产品。PromethION 测序芯片的数据产出是 MinION™ 的六倍，非常适用于大规模基因组测序及高通量多样本实验。P2 Solo 可同时运行两张测序芯片。请点击此处，获取更多信息。
P2 Solo 需连接配备 USB-C 接口（支持 USB 3.0 或更高传输速率）的计算机，以提供电力并控制测序运行。GridION™ 用户可将 P2 Solo 直接接入其测序平台，从而利用 GridION 内置的专用 GPU 和计算资源；其他用户则可选用兼容的高性能工作站。
鉴于 P2 Solo 生成的数据量巨大，选择一台高性能计算机至关重要。若您寻求一体化解决方案，兼具内置与优化的计算能力，我们推荐您选用配备前沿计算硬件的 P2 Integrated。
更多关于 P2 Integrated 的信息，请点击此处。
技术规格
| 组成 | 规格 |
|---|---|
| 尺寸和重量 | 87（高） × 110（宽） × 152（深） mm; 1.5 kg |
| 最大额定功率 | 60 W |
| 安装接口 | 1 × USB Type-C 接口（3.0，传输速率 5 Gbps） 1 x 12 V 直流圆形电源接口 |
| 预装软件 | P2 Solo 驱动 |
| 最优测序环境温度范围 | +18°C 至 +25°C* |
| 最大热量输出 | 205 BTU/小时 |
| 安装要求 | 除底面外，设备各面均预留至少 30 厘米的空间。请勿将设备放置在热源附近。 |
安装场地规划（交付前）
安装注意事项
使用 GridION
P2 Solo 可将 GridION Mk1 作为即插即用的计算资源，充分利用其内置 GPU 实现碱基识别。
即插即用：GridION 的操作系统、固态硬盘（SSD）及内存均经过全面优化，可与 P2 Solo 搭配实现高效测序。
适用的 GridION 型号：为支持 PromethION 测序芯片和所有碱基识别模型的运行，您需使用序列号不低于GXB02xxx 的 GridION Mk1。
更多有关 GridION 的 IT 配置要求（包括网络连接与电力配置），请点击此处。
主机电脑配置要求
由于 P2 Solo 的数据通量巨大，选择适合的计算机至关重要。
为确保计算机能够高效执行数据采集与碱基识别，请参考以下配置要求。使用不符合要求的设备可能导致性能下降、碱基识别速度变慢，甚至测序运行失败。
| 组件 | 推荐配置 |
|---|---|
| 操作系统 | Windows 10/11 Ubuntu 22.04/24.04 LTS |
| CPU | Intel i7+ （12核+） |
| GPU | 桌面版 Nvidia 5090 RTX / RTX PRO 6000 Blackwell 工作站版 / A100 |
| 内存 | 64 GB+ |
| 存储 | 8 TB SSD + |
| 外设接口 | USB Type-C（支持 USB 3.0 或更高传输速度） 显示器（分辨率：1920 × 1080） |
请注意：对于新发布的硬件（如下一代 GPU 或处理器），在 Oxford Nanopore 完成相关测试与优化之前，其兼容性和性能表现尚无法完全保证。
处理器兼容性
- MinKNOW 仅兼容 Intel、AMD 或 Apple Silicon 处理器；
- CPU 须支持 AVX2 指令集（如 Intel Haswell、AMD Steamroller 或更新架构）；
- 不支持搭载 Intel 处理器的 Mac 设备；
- 亦不支持 Qualcomm Snapdragon 及其他基于 ARM 架构的处理器。
笔记本电脑适用性
NVIDIA 显卡提供桌面版和移动版（笔记本）。笔记本具备便携性，但桌面显卡通常在性能、能效及散热管理方面表现更佳。
对于计算密集型任务，台式机通常更为适合；笔记本在长时间高负载下往往难以保持稳定运行。
电脑型号示例
以下列出了一些可配置至符合 P2 Solo 推荐规格的电脑型号。此列表并非详尽。
- Tuxedo Atlas XL | Linux
- System 76 Thelio | Linux
- Alienware Aurora 16 | Windows
- Puget 工作站 | Windows
注意：Oxford Nanopore 与上述供应商无任何隶属关系，且尚未对所列计算机进行全面测试。请在购买前确认其配置符合前述技术规格。
网络与连接要求
USB 连接要求
P2 Solo 需通过 USB-C 接口与工作站计算机连接。请使用随附的 USB Type-C 线缆（约 1 米长），直接插入主板上的 USB-C 接口。
以下连接方式不受支持：
- PCIe 转 USB-C 适配卡（已知可能引发通信错误）
- USB 集线器或扩展坞（可能影响性能）
如工作站主板不具备 USB-C 接口，可改用 USB-C 转 USB-A 线缆。但该所用 USB-A 接口必须支持 USB 3.0 或更高传输速率。
需访问域名
为保证系统功能正常运行，需开放以下域名的出站访问权限：
| 访问类型 | 用途 | 需访问域名 |
|---|---|---|
| 遥测 | 支持 MinKNOW 执行遥测功能并传输遥测数据 | ping.oxfordnanoportal.com |
| 软件与操作系统更新 | 获取 MinKNOW 更新、操作系统软件包和 GPU 驱动程序 | cdn.oxfordnanoportal.com*.ubuntu.com*.nvidia.com |
| EPI2ME™ Labs | 提供容器化的分析流程 | *.github.comhub.docker.com |
| Nanopore 账户登录 | 登录 Oxford Nanopore 账户并访问相关云端服务 | id.nanoporetech.com*.okta.com |
如您的机构使用代理服务器或防火墙，请确保已开放上述域名的出站访问，以保证软件更新、功能运行及用户身份验证的正常进行。
遥测
MinKNOW 和 EPI2ME 在测序运行期间将依据相关条款收集遥测数据，用于设备性能监控、故障排查与技术支持，并作为芯片质保更换的依据（如适用）。
隐私提示：由于部分遥测字段支持自由文本输入，请避免填写任何可识别个人身份的信息。我们不会收集测序数据。
其他系统注意事项
系统行为（如定时更新、杀毒扫描或 IT 管控措施）可能对测序运行造成干扰。
为确保测序过程顺利进行且不被中断，建议您就以下关键事项与所在单位的 IT 部门沟通确认。
| 组件 | 最低要求 |
|---|---|
| 供电 | P2 Solo 与 连接的计算机必须直接接入墙壁电源插座。请勿使用延长线或插线板，以免影响供电稳定性。 |
| 用户账户权限等级 | 安装和更新软件需具备本地管理员权限；执行测序实验则无需管理员权限。 |
| 网络连接 | 系统须始终保持稳定的互联网连接，以确保软件更新和遥测功能的正常运行。 如需离线使用（例如现场作业或野外考察），请联系 support@nanoporetech.com 获取进一步协助。 |
| 杀毒软件设置 | 杀毒软件可能占用大量系统资源，影响测序性能。为避免干扰，建议您关闭自动扫描功能，并在 P2 Solo 未运行时安排手动扫描。 |
| 终端检测软件 | 终端检测类软件可能干扰系统性能。 建议在测序过程中禁用该类软件。 若贵机构的 IT 部门要求使用第三方终端防护软件，请确保已在该软件的外设设置中将与 P2 Solo 相关的代码加入白名单。用户需自行验证此类配置不会影响 P2 Solo 的性能表现。 更多信息，请参阅：如何连接 P2 Solo？ |
| BIOS/芯片组设置与更新 | 请确保 BIOS 固件和芯片组驱动程序均为最新版本。如需使用 EPI2ME 进行数据分析，请确认已启用虚拟化功能。 |
| 操作系统更新设置 | 建议将操作系统更新设置为手动模式，以避免在测序过程中因自动更新而引发问题——尤其当更新涉及系统重启时，将导致测序任务中断。 请与 IT 部门协调，确保单位 IT 管控措施不会覆盖本地设置，从而防止意外更新或重启。 |
包装盒内容物
| 数量 | 部件 | 功能 |
|---|---|---|
| 1 | PromethION 2 Solo | DNA/RNA 测序仪器 |
| 2 | 配置测试芯片（CTC） | 用于验证测序硬件功能（每个测序位置一张） |
| 1 | USB-C 转 USB-C 连接线（1.0 米） | 用于将 PromethION 2 Solo 连接至主机电脑，实现数据传输与控制 |
| 1 | 60 W 电源适配器 | 为 PromethION 2 Solo 提供直流电源 |
| 1 | 快速入门指南 | 系统设置概览 |
| 1 | 安全性及合规性文件 | 安全信息与合规细则 |
| 1 1 1 1 | 英国（Type G → C13) 两米 10 A 250 VAC 电源线 欧盟（Schuko Type C → C13）两米 10 A 250 VAC 电源线 美国（Type B → C13）两米 5 A 125 VAC 电源线 澳大利亚（Type I → C13）两米 10 A 250 VAC 电源线 | 电源线（按地区适配） |
设备安装
- 在设备的前、后及两侧预留至少 30 厘米空间，以确保充分通风并便于操作；
- 请勿将设备放置在笔记本电脑或计算机上方，并远离任何发热源。
数据格式与分析
文件类型
Nanopore 测序数据通常以以下几种文件类型存储：
FASTQ - 一种基于文本的序列储存格式，用于保存 DNA 或 RNA 序列及其对应的质量评分（Q 值）；
BAM - 用于存储经过比对的序列数据，包含修饰碱基信息（如甲基化等）；
sequencing_summary.txt- 储存了单次测序中，与测序序列及碱基识别相关的元数据。其中包括：序列片段编号、序列长度、每条序列片段的质量值、测序时长等。该序列摘要文件的大小取决于所包含的序列片段数量。
可选格式：
- POD5 - 原始数据的标准存储格式，是对早期 FAST5 格式的替代，具有更高的数据存储与处理效率。
下表列出了单张测序芯片在不同测序通量下预计生成的文件大小，涵盖 POD5、FASTQ 和 BAM 三种数据格式，序列片段的 N50 长度为 23 kb。
| 测序芯片产出（Gbases） | FASTQ.gz (Gbytes) | 未经比对的BAM（带修饰） (Gbytes) | （可选） POD5 (Gbytes) |
|---|---|---|---|
| 100 | 65 | 60 | 700 |
| 200 | 130 | 120 | 1400 |
请注意：若启用碱基识别功能，系统将生成 FASTQ 和/或 BAM 文件，并在测序运行期间需要额外的临时存储空间。如果选择启用 POD5 输出，系统将在实验过程中持续生成 POD5 文件。
EPI2ME 分析
EPI2ME 桌面应用程序支持用户灵活配置本地或云端数据分析流程：
本地分析：在本地计算机上运行，利用本地计算资源执行分析任务；
云端分析：依托 Amazon Web Services（AWS）平台，需保持互联网连接。
点击此处，了解 EPI2ME 如何助力您的数据分析工作。
数据上传格式：EPI2ME 支持上传 FASTQ、BAM 及其他与分析流程相关的文件格式。所上传数据将通过定制的 Nextflow 流程进行处理，并生成交互式 HTML 报告。
软件更新
您可通过 MinKNOW 界面或终端（使用 apt）下载更新。系统仅需具备出站访问权限。 我们会在 Nanopore 社区发布软件更新通知，并在发布公告中提供完整的更新操作说明。
数据处理与存储
数据传输
如您将 P2 Solo 与 GridION 搭配使用，并需要额外的 SSD 存储，请正确连接 USB /以太网接口，以确保系统稳定高效运行。
- 请使用GridION背面的蓝色USB Type-A 端口（见上图）。
- 在使用以太网时，请选用 CAT5e 或更高标准的网线（带宽不低于 1 Gbps），并尽量缩短线缆长度以减少延迟。
请勿使用:
白色矩形USB端口
位于设备正面的USB端口（如果您的 GridION 具有前置 USB 端口）
安全与合规
设备型号标识
仪器型号：
PRO-SEQ002 - PromethION 2 Solo
适用领域
Oxford Nanopore Technologies 的 PromethION 2 Solo 是一款为科学研究设计的电子分析平台。其核心技术基于纳米孔，可用于 DNA、RNA、蛋白质及其他小分子的单分子水平研究。
本产品仅供研究使用。
安全性信息
在使用前，请遵循以下安全指南：
- 确保设备除底面外，各面均预留至少 30 厘米空间；
- 请勿将设备放置在笔记本电脑或计算机上方，并远离任何发热源。
紧急措施
如遇紧急情况，请关闭 P2 Solo 的电源开关，并拔下 USB-C 连接线。
符合性声明
PromethION 2 Solo 符合下述《EC 合格声明》中所述的电磁兼容性（EMC）和电气安全指令。
合规标识
国际标准
PromethION 2 Solo 已通过以下国际标准的认证：
| 认证 | 国家 |
|---|---|
| MET；UL61010 / CSA-C22.2 No.61010，第三版：测量、控制和实验室用电气设备的安全要求，修订日期： 2012年5月11日 | 美国和加拿大 |
| 美国联邦通信委员会（FCC） | 美国 |
| RCM 合规要求 | 澳大利亚和新西兰 |
| ISC 安全合规认证 | 柬埔寨 |
| 阿联酋有害物质限制（RoHS）法规 | 阿拉伯联合酋长国 |
| NRCS 和 SABS | 南非 |
| EAC | 欧亚经济联盟关税同盟 |
合规标识
许可及保修
许可协议及保修合同中对向用户提供最新的硬件和软件作出了说明，以确保您的仪器一直处于最佳性能。Oxford Nanopore Technologies 会在合同期内，履行Nanopore产品的条款和条件第4和第7节中所规定的支持义务。
更多信息，请参阅 Oxford Nanopore 商城中的 此页面 。
常见问题
我可以使用与本文件所列配置不同或较旧的计算机吗？
可以，但性能表现（尤其是碱基识别速度）可能因硬件差异而有所不同。其中，GPU 的选择对性能影响最为显著。
硬件兼容性说明：
- 2015 年前发布的计算机可能无法满足运行要求；
- GPU 须支持 CUDA 6.1 或更高版本（如 RTX 10XX 系列或更新型号）；
- CPU 须支持 AVX-2 指令集（如 Intel Haswell、AMD Steamroller 或更新架构）；
- 计算机须具备 USB-C 接口，并支持 USB 3.0 或更高传输标准。
新款硬件：
- 对于新发布的硬件（如下一代 GPU 或处理器），在 Oxford Nanopore 完成相关测试与优化之前，其兼容性和性能表现尚无法完全保证。
我根据旧版本文档购买的计算机，现在是否仍符合要求？
本文件旨在指导用户选购可兼容 P2 Solo 的计算机。由于硬件不断迭代升级，我们会定期更新推荐配置，以反映当前市面上主流且易于采购的设备。如果您现有的计算机仍符合前述配置要求，即可继续正常使用我们的软件。
我计划在其他计算机或高性能计算平台（HPC）上执行碱基识别。对于仅用于数据采集的设备，最低配置有哪些要求？
如果设备仅用于数据采集（即测序过程中不执行碱基识别），则本文档所列的最低配置已足够，且无需配备 GPU。
是否支持使用 Ubuntu 22.04/24.04 LTS 以外的其他 Linux 发行版？
我们建议您仅使用 Ubuntu 22.04 或 24.04 LTS。其他 Linux 发行版未经官方测试与验证，可能存在兼容性问题，且不在技术支持范围内。
为何未提供针对 Mac 的推荐配置？
尽管本软件可在搭载 Apple Silicon 的 Mac 上运行，但在测序性能方面，配备 NVIDIA GPU 的系统表现更为优越，并在碱基识别任务中具有更高的性价比。对于 Apple Silicon 用户，我们仅推荐使用快速碱基识别模式；较大型模型运行耗时较长，无法实时处理测序芯片输出的数据。
更多有关 PromethION 2 Solo 的信息和常见问题，请参阅 P2 Solo 自助服务页面.
附录 A：运输和物流
Oxford Nanopore Technologies 的 P2 Solo 在室温下（+2 至 +25℃）储存并运输。
请注意：启动套装（Starter Pack）中的 P2 Solo 会与试剂盒及测序芯片分开运输。
附件B：兼容性
PromethION 2 Solo 兼容所有最新版本的 PromethION 测序芯片、测序试剂盒及相关扩展包。
兼容范围包括：
- 测序芯片: PromethION R10 系列测序芯片（FLO-PRO114M）、RNA004 PromethION 测序芯片（FLO-PRO004RA）
- 测序试剂盒：PromethION 2 Solo 兼容所有 V14 试剂盒，包括连接法、快速、条形码、PCR、cDNA 及直接 RNA 试剂盒。下述试剂盒未经测试：
- DNA 超长片段测序试剂盒 V14（SQK-ULK114）
- 快速条形码测序试剂盒 V14 （SQK-RBK114.24/96）
- 快速建库测序试剂盒 (SQK-RAD114)
- 16S 条码测序试剂盒 1-24（SQK-16S114.24）
- 组装优化试剂盒（SQK-APK114）
- 测序软件（最新版本）：MinKNOW, Dorado 碱基识别服务器
- 下游分析软件：EPI2ME（含预置分析流程）, Oxford Nanopore 提供的分析流程（MinKNOW 兼容）、 用户自行开发的分析工具 (由纳米孔社区开发）
变更日志
| 日期 | 版本 | 更新内容 |
|---|---|---|
| 2026年1月13日 | 2 | 在第 3 节 “安装场地规划（交付前）” 中的 “网络与连接要求” 小节下，新增了 “需访问域名” 和 “遥测” 两个子项。 |
| 2026年1月7日 | 1 | 本文件整合了 PromethION 2 Solo 技术规格 和 IT 配置要求，形成统一文档。 原有文档现已归档。 新增内容： - 合并两份文档，并重新组织文档结构； - 优化了兼容性章节的表述：以简要说明替代试剂盒代码清单，列出兼容的试剂盒和软件，并标明例外情况； - 新增关于包装盒所含物品的详细说明。 - 在第 3 节（其他系统注意事项）下新增子章节，并在第 8 节（国际标准）下新增子章节。 |
