MinION Mk1D - 设备及 IT 配置规格
Requirements
MinION Mk1D - 设备及 IT 配置规格
FOR RESEARCH USE ONLY
Contents
设备及 IT 配置要求
常见问题
附录 A：运输和物流
附件B：兼容性
变更日志
设备型号
MinION Mk1D（MIN-101D）
设备及 IT 配置要求
概览
MinION™ Mk1D 是一款小巧便携的纳米孔测序仪，专为样本的现场即时测序设计。该设备通过计算机供电，并依托 MinKNOW™ 软件实现测序控制功能。 MinKNOW负责多项核心任务，包括：
- 数据采集和实时分析
- 数据传输与仪器控制
- 实验参数设定
- 样本鉴定及追踪
MinKNOW 不仅能采集原始纳米孔信号，还可通过其内置的机器学习算法，将信号转换为 DNA 或 RNA 序列。
本文档提供了适用于 MinION Mk1D 的技术规格及 IT 配置标准，供用户在选用兼容计算设备时参考。
技术规格
| 组成 | 规格 |
|---|---|
| 尺寸和重量 | 13（高）× 55（宽） × 125（深） mm; 130 g |
| 最大额定功率 | 7.5 W |
| 安装接口 | 1 × USB Type-C |
| 预装软件 | MinION 驱动 |
| 最优测序温度范围 | +10°C to +35°C* |
| 最大散热量 | 25.6 BTU/小时 |
| 安装要求 | 请确保除底面外，设备各面均预留至少 5 厘米的空间。请勿将设备放置在笔记本电脑或任何发热源上方。 |
*电子设备的工作环境温度为+5℃至+40℃。
安装场地规划（交付前）
配置用于运行 MinION Mk1D 的新计算机
为确保计算机能够高效执行数据采集与碱基识别，请参考以下配置要求。使用不符合要求的设备可能导致性能下降、碱基识别速度变慢，甚至测序运行失败。
推荐配置
推荐配置支持实时高精准碱基识别（包括修饰碱基识别，如 CpG 位点上的 5mC/5hmC）、序列比对和适应性采样，并可实现 SUP（超精准）模式下的实时碱基识别。
最低配置
最低配置兼顾性能与成本，可支持高精准碱基识别。数据将在常规的 72 小时测序运行结束后完成处理，供后续分析使用。
最低配置的局限性 ：
对于短时测序或计算密集型任务，可能无法实现实时处理；
可能无法同时运行适应性采样和高精准碱基识别；
采用 SUP（超精准）模式进行碱基识别时，测序完成后可能仍需耗费较长的额外处理时间。
| 组件 | 最低配置 | 推荐配置 |
|---|---|---|
| 操作系统 | Windows 10/11 Ubuntu 22.04/24.04 LTS MacOS† †请注意，我们将停止对 MacOS 14（Sonoma）以下版本的支持；MacOS 13（Ventura）及更早版本将不再支持安装 MinKNOW。 | Windows 10/11 Ubuntu 22.04/24.04 LTS |
| 接口 | USB Type-C （USB 2.0 或更高） | USB Type-C （USB 2.0 或更高） |
| 内存 | 16 GB + Apple: 24 GB + 统一内存 | 32 GB + |
| GPU | NVIDIA RTX 5060 笔记本 GPU+ Apple: M4 Pro + | NVIDIA RTX 5090 笔记本 GPU |
| CPU | Intel I5 + / AMD Threadripper + / Apple M4 Pro + （6 核及以上） | Intel I7 + （12 核及以上） |
| 存储 | 1 TB SSD + | 2 TB SSD + |
请注意 ：对于新发布的硬件（如下一代 GPU 或处理器），在 Oxford Nanopore 完成相关测试与优化之前，其兼容性和性能表现尚无法完全保证。为确保最佳兼容性和性能表现，请将软件更新至最新版本。 标有 “+” 的硬件表示该规格及更高配置均适用。
处理器兼容性
MinKNOW 仅兼容 Intel、AMD 或 Apple Silicon 处理器；
CPU 须支持 AVX2 指令集（如 Intel Haswell、AMD Steamroller 或更新架构）；
不支持搭载 Intel 处理器的 Mac 设备；
亦不支持Qualcomm Snapdragon 及其他基于 ARM 架构的处理器。
网络与连接要求
USB 连接要求
MinION Mk1D 必须通过 USB-C 接口连接计算机。由于其仅需 USB 2.0 级别的数据传输速率，因此所有具备数据传输功能的 USB-C 接口均可兼容使用。
- 请勿使用 USB-A 转 USB-C 适配器或数据线，因 USB-A 接口可能无法提供足够电力。
系统的正常运行与更新依赖于网络访问权限。所有网络连接均为出站连接，通过 TCP 端口 80 和 443 进行通信，无需开启任何入站端口。
Oxford Nanopore 无法远程访问您的系统。
| 访问类型 | 用途 | 所需域名 |
|---|---|---|
| 遥测 | 支持 MinKNOW 执行遥测功能并发送相关数据 | ping.oxfordnanoportal.com |
| 软件与操作系统更新 | 获取 MinKNOW 更新、操作系统软件包和 GPU 驱动程序 | cdn.oxfordnanoportal.com *.ubuntu.com *.nvidia.com |
| EPI2ME | 访问容器化分析流程 | *.github.comhttp://hub.docker.com |
| Nanopore 账户登录 | 登录 Oxford Nanopore 账户并访问相关云端服务 | id.nanoporetech.com *.okta.com |
注意 ：如您所在机构部署了代理服务器或防火墙，请确保上述域名的出站访问已开放，以免影响软件更新、功能使用及用户身份验证。
遥测
MinKNOW 和 EPI2ME™ 在测序运行期间将依据相关条款收集遥测数据，用于设备性能监控、故障排查与技术支持，并作为芯片质保更换的依据（如适用）。
隐私提示 ：由于部分遥测字段支持自由文本输入，请避免填写任何可识别个人身份的信息。我们不会收集任何测序数据。
其他系统注意事项
系统行为（如定时更新、杀毒扫描或 IT 管控措施）可能对测序运行造成干扰。
为确保测序过程顺利进行且不被中断，建议您就以下关键事项与所在单位的 IT 部门沟通确认。
| 组件 | 最低要求 |
|---|---|
| 用户账户权限等级 | 安装和更新软件需具备本地管理员权限；执行测序实验则无需管理员权限。 |
| 网络连接 | 系统须始终保持稳定的互联网连接，以确保软件更新和遥测功能的正常运行。 如需离线使用（例如现场作业或野外考察），请联系 support@nanoporetech.com 获取进一步协助。 |
| 杀毒软件设置 | 杀毒软件可能占用大量系统资源，影响测序性能。为避免干扰，建议您关闭自动扫描功能，并在 MinION 未运行时安排手动扫描。 |
| 终端检测软件 | 终端检测类软件可能干扰系统性能。 建议在测序过程中禁用该类软件。 |
| BIOS/芯片组设置与更新 | 请确保 BIOS 固件和芯片组驱动程序均为最新版本。如需使用 EPI2ME 进行数据分析，请确认已启用虚拟化功能。 |
| 操作系统更新设置 | 建议将操作系统更新设置为手动模式，以避免在测序过程中因自动更新而引发问题——尤其当更新涉及系统重启时，将导致测序任务中断。 请与 IT 部门协调，确保单位 IT 管控措施不会覆盖本地设置，从而防止意外更新或重启。 |
包装盒内容物
| 数量 | 部件 | 功能 |
|---|---|---|
| 1 | MinION Mk1D | DNA/RNA 测序仪器 |
| 1 | MinION 配置测试芯片（CTC） | 用于验证测序硬件功能 |
| 1 | USB-C 0.5 m 连接线 | 用于将 MinION 连接至兼容计算机 |
| 1 | 快速入门指南 | 系统设置概览 |
| 1 | 安全性及合规性文件 | 安全信息与合规细则 |
设备安装
在设备的前、后及两侧预留至少 5 厘米空间，以确保充分通风并便于操作；
请勿将设备放置在笔记本电脑或计算机上方，并远离任何发热源。
数据格式与分析
文件类型
Nanopore 测序数据通常以以下几种文件类型存储：
FASTQ - 一种基于文本的序列储存格式，用于保存 DNA 或 RNA 序列及其对应的质量评分（Q 值）；
BAM - 用于存储经过比对的序列数据，包含修饰碱基信息（如甲基化等）；
sequencing_summary.txt- 储存了单次测序中，与测序序列及碱基识别相关的元数据。其中包括：序列片段编号、序列长度、每条序列片段的质量值、测序时长等。该序列摘要文件的大小取决于所包含的序列片段数量。
可选格式：
POD5 - 原始数据的标准存储格式，是对早期 FAST5 格式的替代。POD5 在数据存储和处理效率方面都有更加高效。
下表列出了单张测序芯片在不同测序通量下预计生成的文件大小，涵盖 POD5、FASTQ 和 BAM 三种数据格式，序列片段的 N50 长度为 23 kb。
| 测序芯片产出 （Gbases） | POD5（Gbytes） | FASTQ.gz（Gbytes） | 未经比对的BAM（带修饰）（Gbytes） |
|---|---|---|---|
| 10 | 70 | 6.5 | 6 |
| 15 | 105 | 9.75 | 9 |
| 30 | 210 | 19.5 | 18 |
| 50 | 350 | 35 | 30 |
注意 ：若启用碱基识别功能，系统将生成 FASTQ 和/或 BAM 文件，并在测序运行期间需要额外的临时存储空间。如果选择启用 POD5 输出，系统将在实验过程中持续生成 POD5 文件。
EPI2ME 分析
EPI2ME 桌面应用程序支持用户灵活配置本地或云端数据分析流程：
本地分析：在本地计算机上运行，利用本地计算资源执行分析任务；
云端分析：依托 Amazon Web Services（AWS）平台，需保持互联网连接。
点击此处，了解 EPI2ME 如何助力您的数据分析工作。
数据上传格式：EPI2ME 支持 FASTQ、BAM 及其他与分析流程相关的文件格式。数据将通过定制的 Nextflow 流程进行处理，并生成交互式 HTML 报告。
软件更新
您可通过 MinKNOW 界面或终端（使用 apt）下载更新。系统仅需具备出站访问权限。 我们会在 Nanopore 社区发布软件更新通知，并在发布公告中提供完整的更新操作说明。
安全与合规
仪器型号标识
仪器型号：
MIN-101D - MinION Mk1D
适用领域
Oxford Nanopore Technologies 的 MinION Mk1D 是一款为科学研究设计的电子分析平台。其核心技术基于纳米孔，可用于 DNA、RNA、蛋白质及其他小分子的单分子水平研究。
本产品仅供研究使用 。
安全性信息
在使用前，请遵循以下安全指南：
确保设备除底面外，各面均预留至少 5 厘米空间；
请勿将设备放置在笔记本电脑或任何发热源上方。
紧急措施
如遇紧急情况，请关闭计算机的电源开关，并拔下 USB-C 连接线。
符合性声明
MinION Mk1D 符合《EC合格声明》中所述的电磁兼容性（EMC）和电气安全指令。
合规标识
国际标准
MinION Mk1D 已通过以下国际标准的认证：
| 认证 | 国家 |
|---|---|
| MET；UL61010 / CSA-C22.2 No.61010，第三版：测量、控制和实验室用电气设备的安全要求，修订日期： 2012年5月11日 | 美国和加拿大 |
| 美国联邦通信委员会（FCC） | 美国 |
| RCM 合规要求 | 澳大利亚和新西兰 |
| ISC 安全合规认证 | 柬埔寨 |
| 阿联酋有害物质限制（RoHS）法规 | 阿拉伯联合酋长国 |
| NRCS 和 SABS | 南非 |
| EAC | 欧亚经济联盟关税同盟 |
许可及保修
许可协议及保修合同中对向用户提供最新的硬件和软件作出了说明，以确保您的仪器一直处于最佳性能。Oxford Nanopore Technologies 会在合同期内，履行 Nanopore 产品的条款和条件第4和第7节中所规定的支持义务
更多信息，请参阅 Oxford Nanopore 商城中的支持计划页面 。
支持
更多有关 MinION Mk1D 的信息和常见问题，请参阅我们的 设备支持页面。
常见问题
我可以使用与本文件所列配置不同或较旧的计算机吗？
可以，但性能表现（尤其是碱基识别速度）可能因硬件差异而有所不同。其中，GPU 的选择对性能影响最为显著。
硬件兼容性说明
旧款硬件：
2015 年前发布的计算机通常不兼容；
GPU 须支持 Compute Capability 6.1 或更高版本（如 RTX 10 系列或更新型号）；
CPU 须支持 AVX2 指令集（如 Intel Haswell、AMD Steamroller 或更新架构）；
计算机须具备 USB-C 接口，并支持 USB 2.0 或更高传输标准。
新款硬件：
- 对于新发布的硬件（如下一代 GPU 或处理器），在 Oxford Nanopore 完成相关测试与优化之前，其兼容性和性能表现尚无法完全保证。
我根据旧版本文档购买的计算机，现在是否仍符合要求？
本文件用于指导用户选购可兼容 MinION Mk1D 的计算机。随着硬件的持续升级，我们会定期更新推荐配置，以反映当前市面上主流且易于购买的设备。如果您现有的计算机仍符合第 1 条中的配置要求，即可继续正常使用我们的软件。
我计划在其他计算机或高性能计算平台（HPC）上执行碱基识别。对于仅用于数据采集的设备，最低配置有哪些要求？
如果设备仅用于数据采集（即测序过程中不执行碱基识别），则本文档所列的最低配置已足够，且无需配备 GPU。
是否支持使用 Ubuntu 22.04/24.04 LTS 以外的其他 Linux 发行版？
我们建议您仅使用 Ubuntu 22.04 或 24.04 LTS。其他 Linux 发行版尚未经官方测试与验证，可能存在兼容性问题，且不在技术支持范围内。
为何未提供针对 Mac 的推荐配置？
尽管本软件可在搭载 Apple Silicon 的 Mac 上运行，但在测序性能方面，特别是当运行 SUP（超精准）等资源密集型模型时，配备 NVIDIA GPU 的系统表现更优，在碱基识别任务中也具有更高性价比。
附录 A：运输和物流
Oxford Nanopore Technologies MinION 设备在室温下（+2°C 至 +25°C）储存并运输。MinION测序仪或包装于衬垫信封中单独运输，或置于装运箱内同测序芯片及试剂一起运输。
请注意：启动套装（Starter Pack）中的 MinION 会与试剂盒及测序芯片分开运输。
附件B：兼容性
MinION Mk1D 兼容所有最新版本的 MinION/GridION 测序芯片、测序试剂盒及相关扩展包。
兼容范围包括：
测序芯片：
MinION 与 GridION R10 系列测序芯片（FLO-MIN114）
Flongle R10 系列测序芯片（FLO-FLG114）
RNA004 MinION 测序芯片（FLO-MIN004RA）测序试剂盒：MinION 兼容所有 V14 试剂盒，包括连接法、快速、条形码、 超长、PCR、cDNA、16S 及直接 RNA 试剂盒。
测序软件（最新版本）：MinKNOW, Dorado 碱基识别服务器
下游分析软件：EPI2ME（含预置分析流程）, Oxford Nanopore 提供的分析流程（MinKNOW 兼容）、 用户自行开发的分析工具 (由纳米孔社区开发）
变更日志
| 日期 | 版本 | 更新内容 |
|---|---|---|
| 2026年4月23日 | 3 | 在第3节“安装场地规划”中相关表格的“操作系统”一行，新增说明，告知用户：MacOS 13（Ventura）及更早版本将不再支持安装 MinKNOW。 |
| 2026年4月22日 | 2 | - 在第3节“安装场地规划”的“配置用于运行 MinION Mk1D 的新计算机”部分中，已删除对特定 MinKNOW 版本的引用。 已更新“最低配置的局限性”表格中的脚注内容，提示用户需将软件更新至最新版本，以确保最佳兼容性和性能表现。 |
| 2026年1月7日 | 1 | 本文件整合了 MinION Mk1D 技术规格和 IT 配置要求，形成统一文档。现有文档现已归档。 新增内容： - 合并两份文档，并重新组织文档结构； - 优化了兼容性章节的表述：以简要说明替代试剂盒代码清单，列出兼容的试剂盒和软件，并标明例外情况； - 新增 UPS 选择与适用性说明； - 新增关于包装盒所含物品的详细说明。 - 在第 3 部分（其他系统注意事项）下新增一小节，并在第 8 部分（国际标准）下新增另一小节。 |
