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Virtual Nanopore Day, Japan

2021年10月27日(水)-28日(木) に、オンラインにてVirtual Nanopore Day, Japanを開催し、ナノポアシークエンスを活用中の先生方から研究への応用例を日本語にてご講演いただきました。

 

Virtual Nanopore Day, Japan was held online from October 27th (Wednesday) to 28th (Thursday), 2021. You will hear the talks from local Japanese scientists about their latest work using nanopore technology.

微生物に関するセッション

Session on microbiology

演者: 東京大学先端科学技術研究センター 生命データサイエンス分野 特任講師 上田宏生

演題:nanoDoc を用いたRNA修飾の検出

 

演者: 公益財団法人結核予防会 結核研究所 生体防御部 部長 土方美奈子

演題:ベトナム中部における結核菌 lineage 1 サブグループの遺伝子型の特徴

 

Presenter: Hiroki Kiyose, University of Tokyo

Title: RNA modification detection using nanoDoc

Presenter: Minako Hijikata, The Research institute of Tuberculosis, Japan Anti-Tuberculosis Association

Title::Genotypic features of the Mycobacterium tuberculosis lineage 1 subgroup in central Vietnam

ヒトゲノムに関するセッション

Session on human genomics

演者: 東京大学大学院 医学系研究科国際保健学専攻人類遺伝学教室 清瀬大樹

演題:ロングリードシーケンシング技術を用いた肝癌の完全長のトランスクリプトーム解析

 

演者: 信州大学医学部 人口聴覚気学講座 特任講師 西尾信哉

演題:ヒト難聴遺伝子解析の進展とNanoporeを用いた解析

 

Presenter: Hiroki Kiyose, University of Tokyo

Title: Full-length transcriptome analysis of liver cancer using a long-read sequencing technology

 

Presenter: Shinya Nishio, Shinshu University School of Medicine

Title::Recent progresses in genetic analysis and nanopore sequencing in hereditary hearing loss

非モデル生物

Session on plant and animal genomics

演者: 農研機構 遺伝資源研究センター 上級研究員 内藤健

演題:PromethIONと植物ゲノム

 

演者: 東京海洋大学大学院 ゲノム科学研究室 川戸智

演題:クルマエビのドラフトゲノム

 

Presenter: Ken Naito, Research Center of Genetic Resources, National Agriculture and Food Research Organization

Title: Tricks to assemble your plant genome

 

Presenter: Satoshi Kawato, Tokyo University of Marine Science and Technology

Title: Draft genome assembly of the kuruma shrimp, Marsupenaeus japonicus