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应对宏基因组分析的挑战

White paper

Date: 30th April 2020

对来自单个样本的多种微生物进行基因组分析(通常称为“宏基因组测序”),可以深入了解微生物群落的遗传组成。传统的微生物研究是使用人工培养基,通过培养单个物种或菌株来进行。然而据估计,只有不到 2% 的细菌可在实验室中培养。据计算,仅噬菌体而言,就有大约 1 亿种类型尚未被发现。因此,对于环境中微生物的遗传多样性,我们还有待深入了解。随着 DNA 测序技术的进步,现在已能够对包含多个物种的样本进行基因组分析,从而有可能从未经培养的微生物中获得完整或近乎完整的基因组序列。这对研究微生物的生物学、生态学和进化来说是一种重要的手段。然而,许多挑战仍然存在,尤其是对于时间紧迫或在偏远地区采样的应用,例如疫情爆发调查和病原体监测。在这篇综述中,我们将探讨宏基因组研究面临的各种挑战,并通过真实案例,介绍目前如何利用纳米孔测序技术来应对这些挑战。

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