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使用直接RNA和cDNA测序分析RNA和基因表达

不同于传统的RNA测序技术,长读长纳米孔RNA测序无需经过片段化或扩增,可对天然RNA或cDNA进行准确定量,以及完整的全长鉴定——分析精简,且移除潜在偏好性来源。直接RNA测序还可在鉴定核苷酸序列的同时鉴定碱基修饰。

  • 使用长读长鉴定和定量全长转录本
  • 通过实时分析和定制的工具更快速地访问结果
  • 使用无需PCR的实验方案降低偏好性
  • 通过直接RNA测序探索表观遗传修饰
  • 根据您的需求使用MinION、GridION或PromethION扩大规模

定量和研究基因差异性表达

鉴定融合转录本

鉴定RNA病毒和病毒流行病学

检测碱基修饰

纳米孔技术所提供的高产长读长、全长读长能够对转录本异构体进行明确的鉴定和定量,提供对基因表达的真实反映。低量起始材料结合快速、精简的工作流程能够对基因表达进行高灵敏度分析,甚至是从单细胞中。

  • 全长转录本——明确鉴定剪接变体和基因融合
  • 准确的转录本和异构体定量
  • 使用直接cDNA或直接RNA测序消除PCR偏好性
  • 使用直接RNA测序,在核苷酸测序的同时检测碱基修饰
  • 易于鉴定反义转录物和lncRNA异构体
  • 新发布:使用更新的RNAcDNA测序试剂盒,从更少的起始材料中获得更高的产量

在纳米孔测序中,读长长度与片段长度一致,使其能够常规分析长的全长转录本。这将多重定位——短测序读长比对到多个位置的影响减少到了最小,从而能够完整鉴定转录本异构体和嵌合转录本。同时还能确定定相(phasing),从而易于区分克隆及多克隆变体。

  • 明确鉴定全长融合转录本和变体的定相(phasing)
  • 准确的转录本定量
  • 快速、实时测序和分析
  • 使用直接cDNA或直接RNA测序消除PCR偏好性
  • 适用于任何实验室的简单、具有成本效益、以及可扩展的解决方案 
  • 新发布:使用更新后的RNAcDNA测序试剂盒,从更少的起始材料中获得更高的产量

使用实时、长读长RNA测序,在实验台或实地快速鉴定RNA病毒。

  • 单条读长包含完整病毒RNA序列——无需组装
  • 长读长增强从宏基因组样本中进行的病毒鉴定
  • 使用便携式设备和测序试剂盒进行快速、实地分析
  • 实时分析可立即提供具有行动指导意义的结果
  • 可选择具有经济效益的混样建库测序
  • 新发布: 使用更新后的 RNAcDNA 测序试剂盒,从更少的起始材料中获得更高的产量

碱基修饰,如m6A,可调节RNA分子的活性和稳定性,并与多种人类疾病和抗菌素耐药性相关。与传统技术不同,纳米孔技术可以对天然RNA分子进行测序。无需扩增或逆转录,纳米孔测序可直接鉴定核苷酸序列旁的碱基修饰,无需改编化学或实验方案。对全长转录本进行测序的功能可以明确将修饰匹配到特定的异构体。

  • 经济高效地鉴定RNA碱基修饰以及核苷酸序列
  • 常规捕获修饰的碱基,准备就绪即可进行分析y
  • 使用长序列、全长序列明确地将碱基修饰匹配到转录异构体
  • 简化的实验方案,无需苛刻或低效的改编化学方法,保持RNA分子和数据的完整性
  • 使用Tombo分析数据,Tombo是日益增多的分析工具之一

选择您的RNA测序试剂盒

  直接RNA测序试剂盒 PCR-cDNA测序试剂盒 直接cDNA测序试剂盒
制备时间 105 分钟 165 分钟 275 分钟
起始量要求 500 ng RNA (poly-A+) 1 ng RNA (poly-A+) 100 ng RNA (poly-A+)
是否需要RT 可选
是否需要PCR
读长长度 等同于RNA长度 富集全长cDNA 富集全长cDNA
典型通量
典型读长数量 100 万 700万-1200万 500万-1000万
混样建库选择 研发中 PCR条码试剂盒 无扩增条形码扩展试剂盒
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