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纳米孔测序用于快速、智能的食品安全测试

Mon 25th March 2019

GridION X5 sequencing at Clear Labs

食源性污染物 每年在美国造成9千4百万人患病, 食品制造商每次事故的平均召回成本为1500万美元。仅沙门氏菌 Salmonella 一项便能导致100万人感染这些疾病。

当病原体进入工厂或食品供应链时,它们会迅速蔓延,对消费者造成伤害,并对行业造成干扰。在这种情况下,快速了解病原体是否存在、以及它们是什么类型的病原体非常关键,这使得行业能够及早采取精确的行动进行干预,以取得更好的结果。

大规模自动化的纳米孔测序

今天, Clear Labs 宣布了 其整合纳米孔测序,通过使用GridION X5测序仪进行快速周转的病原体检测的食品安全解决方案——“Clear Safety”。

Clear Labs开发了一种“样品到答案”的解决方案,这种方案基于全自动机器化设备,可在24小时内进行高容量的血清型和病原体鉴定。我们对这种高影响力的纳米孔测序应用感到兴奋。

Oxford Nanopore测序:迈向更多常规测试

这是据我们所知的、第一次Oxford Nanopore的DNA测序技术被用于全自动测试,包括机器化文库制备。此外,食品安全测试是经AOAC认可的*。

对于大批量的快速测试而言,对纳米孔技术进行更简易或更自动化地使用可以使许多行业受益,无论是在研究、还是在受到监管更多的环境中。下面是我们准备拓展纳米孔测序的常规用途的一些方法:

自动化或易用性

  • 在公司内部,我们一直在开发能够将纳米孔测序与高通量文库制备的机器化方法相结合的工作流程。
  • VolTRAX V2,我们的自动化、可编程、USB驱动的文库制备,现在处于早期试用阶段。 
  • MinION Mk1C 是一款将MinION或Flongle测序芯片与强大的计算和屏幕相结合的设备,可在任何环境中快速测序,无需使用笔记本电脑。

高通量,频繁使用

  • 按需测序:PromethION和GridION为模块化设计,因此用户可以立即运行单个测序芯片,无需对样品批量处理,以便快速获得结果。
  • 如果测试仅需要少量的测序数据,则可以使用专为低成本、快速测试而设计的新的Flongle。 我们对即将看到的Flongle首次应用感到很兴奋。它将会是病原体ID?  靶向测序?  在大规模测序之前测试样品? 还是教育? 
  • 我们不断扩大生产规模,以应对不断增加的产品的需求,并将在今年开设一个新的高科技生产设施车间

实时数据

  • 纳米孔测序可以独特地实时传输测序数据,这意味着可以在开始实验后立即分析数据,因此可以迅速获得相关见解,这在例如食品安全测试的许多决策中都非常关键。

质量标准和系统

  • Oxford Nanopore最近获得了ISO 9001:2015认证,这是一个快速发展的公司迈出的重要一步。这有助于我们继续构建和改进在业务流程中保持高质量水平所需的工具和方法。
  • 它为客户提供了保证,尤其是那些在确保供应链安全方面具有特定要求的客户,即Oxford Nanopore坚定地提供符合其需求和期望的高质量产品。
  • ISO 9001:2015还提供了Oxford Nanopore为进入未来市场计划建立的质量管理平台。 

阅读更多内容: AgFunder News


官方农业化学家协会(Association of Official Agricultural Chemists; AOAC),现为AOAC International,标准化方法的出版商,最着名的是化学或微生物分析。政府机构或其他组织经常要求AOAC标准。 
 

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